有限公司和个体户在上海注册公司有很大的区别，各有各的长处和短处：

　　1、个体户不享受税收优惠政策，不需要会计做帐，有限公司则需每个月做帐和报税，可以享受税收优惠政策，这仅是表面。

　　假如开一个小饭馆，进货不需要发票，注册为个体户比较合适。

　　2、有限公司有增值税专用发票，可以抵扣，而个体工商户不可以申请增值税专用发票，只能申请小规模纳税人。如果与正规大企业做生意，个体户在税收方面有先天弊端。

　　3、纳税及税收计算方式不同：个体工商户可以是定税，不论当月的收入多少，有无收入都要按定税金额来交税。这对于营业额较好的企业，无疑是好消息。有限责任公司则要求企业必须核算健全要有帐目，交税也是根据企业自己申报的收入来交税，有收入就交，没有就不交。

　　个体工商户的经营所得只缴个人所得税，有限责任公司的经营所得既要缴企业所得税，也要缴纳个人所得税。个体工商户采取定额定率征收，有限责任公司的征收，营业交易环节按发票征税，经营所得环节一般采取核定征收或查帐征收两种方式。

　　4、公司章程区别

　　个体工商户注册登记时无需公司章程，而有限责任公司注册时则需要公司章程。